《合金弹头3无敌版》是一款经典的街机游戏，由玩家修改。合金弹头3无敌版的游戏方式仍然继承自之前的合金弹头系列作品，但首次出现了分支路线的设定前四关均可以有多种不同路线可供选择，每条路线的场景和敌人均不同的。在无敌版中你可以无视敌人的子弹而且你的武器和弹药也是无限的，整体只图一个爽字。
莫丁将军妄图建立世界新秩序的反叛业已成为历史，和平与秩序开始重归世界。虽然东山再起的莫丁势力开始策划新一场政变，但已洞察迹象的政府军也已准备好了新一次的对反叛者的打击。
在镇压莫丁反叛中立下汗马功劳的“游隼”队员马可和塔尔玛在退役申请被驳回后被继续任命带领队伍作战。因为莫丁虽然已被他的追随者们认为失踪，但这些追随者们依然潜藏在世界各个角落，而马可和塔尔玛的能力和经验是对付他们的有效利器，通过对反叛军的战斗，二人发现了莫丁和这个新的征服世界的邪恶计划的千丝万缕的联系。
另一方面，隶属政府情报机关的“麻雀”部队在游隼对莫丁的追击的同时也遭遇一系列奇怪事件：神秘消失的家畜、政府官员的失踪，还有反常的巨大生物。诸多事件表明了一个可怕的事实：莫丁并不是唯一值得提防的对象。最后发现：曾在前一次莫丁叛乱中出现的外星人回来了！在共同的敌人面前，政府军和莫丁反乱军组成了反抗外星人的联盟。
完美、流畅、复古的游戏画面
多种可驾驶机械。
快速紧张的游戏节奏；
丰富的武器和道具。
本作是系列游戏的第三部，几乎继承了系列的优点和特色但同时也是难度最高的一款，游戏共有5关，游戏风格和玩法很接近飞行射击，除了传统的动作射击版面，游戏还增加了水下射击版、横版飞行射击和纵版飞行射击等。这个版本是无敌版的，不用害怕无法通关。
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