《拳皇13》（The King of Fighters XIII）是一款街机、格斗游戏，这次八神在暴走的情况下打败了已负伤的草薙（ti）京，随之阿修出现将八神击败并拿走了他的苍炎，最后阿修掌握三大神器中的两样，当收集到第三样神器时可能会毁灭世界，所以KOF的战士全都赶去阻止这一可怕计划的发生。
拳皇XI中，祸忌先是被草薙京、八神庵击败，又紫苑投出的长枪所贯穿后失掉其生命，紫苑则消失于次元的裂缝。但是余下的一族们像嘲笑一般夺走了由海顿所率领的调查部队的努力成果，现身于其面前。他们所说的遥远彼之地是什么？为何要执着的要寻求大蛇之力呢？
另一方面，八神因为受活性的大蛇之血支配而暴走，将本来就精疲力尽的草薙京击倒在地，阿修·克里门森突然出现，打败了暴走八神庵（此时八神虽暴走，但体力也消耗得差不多）并夺其神器及苍炎，摆脱伊丽莎白的阻止。随着神乐之后，已得到八神力量。八咫之镜已破。八咫琼勾玉已碎三种神器之中只余下草薙之剑。
时期到来了。相继的遭遇事故，一直被担心能否举行的KOF大会。可是，被某人强行推动下，KOF大会竟相反的成为史上最大的形式来进行。以世界各地为擂台，在空前绝后的规模下举行的异种格斗大会在前所未有的华丽报道下升温。然后，第13届拳皇大会（拳皇XIII）的挑战书送往强者们……
画 面：全体角色都比以前要小，画面容易看清楚，美观多了。色彩亮丽，没有看不清角色的场地。
系 统：CC、相杀、反击CD、连续技中接入CD等KOFXII的系统全部删除。44缩短距离的设定也删除了。投的方式回归以前的方向键+重攻击，拆投恢复。挥空取消复活。全角色追加远距离普通技。
破 防：体力槽下的就是防御值槽，该槽空了即破防。现状来说，因为防御槽恢复速度很快，还比较难打出破防，而且硬直并不长，所以即使破防能够追击大伤害的机会也不多。但是，发动HYPER DRIVE 后强制连续防御的话还是有机会破防的。CD反击废气CD反击回归。防御中消耗1格能量实现。有伤害，但是当对方HP为0时，CD反击的伤害不会杀死对方。
气 绝：绝复活，但是没有明显的气绝槽，要凭感觉把握。跟98、02的方式完全相同，第1个人3格气，第2个4格，第3个5格。蓄气速度比98略快。
投币：右shift
方向键：上下左右
轻拳：Z
重拳：X
轻脚：A
重脚：S
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